L'organització de l'Ajuntament de Sant Joan Despí està distribuïda en tres àrees:
ÀREA DE TERRITORI, ESPAI PÚBLIC I MEDI AMBIENT
Responsable del planejament i la gestió urbanística; prevenció i control ambiental de les activitats; planejament i gestió de l'obra pública; habitatge; manteniment d'infraestructures, equipaments i serveis municipals; cementiri municipal; mobilitat urbana; via pública; manteniment de l'espai públic; neteja viària; parcs i jardins; sostenibilitat i sensibilització medi ambiental i de patrimoni natural; agricultura; il·luminació i clavegueram; residus; eficiència energètica; Parc Agrari; espai fluvial; horts urbans; benestar animal i transició ecològica.
- PLANEJAMENT URBANÍSTIC, SOSTENIBILITAT AMBIENTAL, MOBILITAT I HABITATGE
- VIA PÚBLICA
- BENESTAR ANIMAL, ESPAIS NATURALS I PARC AGRARI
ÀREA DE SERVEIS A LES PERSONES
Coordinació de les polítiques de promoció de la cultura, l’esport i la dinamització associativa; de les polítiques educatives; de les polítiques a les persones, el seu desenvolupament personal i el seu benestar.
- CULTURA, PROMOCIÓ ASSOCIATIVA I TURISME
- ESPORTS I JOVENTUT
- EDUCACIÓ, INFÀNCIA I FAMÍLIA
- GENT GRAN
- SALUT
- POLÍTIQUES SOCIALS, COMUNITÀRIES I DIVERSITATS
- IGUALTAT I POLÍTIQUES LGTBI
- COOPERACIÓ I SOLIDARITAT
ÀREA DE GOVERNANÇA I DESENVOLUPAMENT LOCAL
Encarregada de l'elaboració del Pla d'Actuació Municipal, dinamització econòmica, seguretat pública, gestió de recursos humans i modernització i transparència.
- SEGURETAT CIUTADANA, CONVIVÈNCIA I SERVEIS GENERALS
- PROMOCIÓ ECONÒMICA I OCUPACIÓ
- COMERÇ, CONSUM I MERCATS MUNICIPALS
- TRANSPARÈNCIA, BON GOVERN I PARTICIPACIÓ